Mączka rybna musi być zapakowana przed przechowywaniem lub dostawą. Worek opakowaniowy zazwyczaj wykorzystuje tkany worek polietylenowy. Prace opakowaniowe można podzielić na dwa rodzaje pakowania mechanicznego i pakowania ręcznego. Ręczny sprzęt do pakowania jest bardzo prosty, wystarczy waga i przenośna maszyna do szycia oraz inne proste narzędzia. A stopień automatyzacji pakowania zależy od wielkości produkcji i możliwości przetwórczych fabryki. Opakowania mechaniczne o wyższym stopniu automatyzacji zostały przyjęte przez coraz więcej producentów. System nadaje się do obsługi linii montażowej, zwartej konstrukcji, mniejszej powierzchni zajmowanej przez pracowników, dokładnego ważenia i pomiaru, co może poprawić wydajność pracy, zmniejszyć pracę i obniżyć koszty produkcji. Gotową w workach mączkę rybną po zaplombowaniu można wysłać bezpośrednio do magazynu w celu przechowania.
Automatyczny system pakowania składa się głównie z przenośnika ślimakowego do pakowania, automatycznej ilościowej wagi do pakowania, przenośnika taśmowego z urządzeniem ważącym i wyświetlaczem oraz maszyny do szycia. Jego proces ważenia i pakowania polega na wykorzystaniu funkcji sterowania programem kontrolera ważenia w celu realizacji sterowania podawaniem przenośnika ślimakowego do pakowania, aby uzyskać dokładny efekt pomiarowy. Po zakończeniu ważenia worki są przenoszone do maszyny do szycia worków przez przenośnik taśmowy w celu zakończenia prac zgrzewających. Gotową mączkę rybną w workach po zapieczętowaniu można bezpośrednio wysłać do magazynu w celu przechowania. Ten automatyczny system pakowania może również zaspokoić potrzeby innych materiałów sproszkowanych, które są bardzo popularne zarówno na rynku krajowym, jak i międzynarodowym.